Taller en San Luis: Herramientas básicas de Bioinformática y Biología molecular
Comienza el 6 de diciembre en la Universidad de San Luis.
El 6 de diciembre dará comienzo el Taller sobre Herramientas básicas de Bioinformática y Biología molecular dirigido a biólogos, bioquímicos, biólogos moleculares y estudiantes avanzados interesados en aplicar estas herramientas en diversas áreas de estudio. El taller tiene como objetivo principal generar un espacio de discusión para el mejor aprovechamiento posible de las herramientas básicas de biología molecular y de los conocimientos existentes en los diversos proyectos de investigación.
No es necesario poseer conocimientos profundos en biología molecular. Se sugiere que cada interesado lleve al taller un pequeño resumen de las actividades donde podría aplicar las herramientas a analizar.
Las clases teóricas y discusión de problemas típicos se llevarán a cabo los días 6, 7, 9 y 10 de diciembre de 15 a 18 hs. El uso práctico de herramientas bioinformáticas los días 13 y 14 de diciembre. Se aplicarán las herramientas analizadas en problemas concretos de cada trabajo de investigación.
Los temas que se desarrollarán están vinculados al Análisis de secuencias de ADN y proteínas. Búsqueda de sitios de restricción en secuencias de ADN (programa Webcutter 2.0). Diseño de oligonucleótidos para PCR (programa OligoCalc). Traducción de secuencias de ADN y búsqueda de marcos abiertos de lectura. Búsqueda de exones e intrones en secuencias de ADN. Búsqueda de secuencias mediante homología; BLASTn, BLASTp, tBLASTn, tBLASTx. Alineamiento de múltiples secuencias; CLUSTALW. Búsqueda de secuencias conservadas y variables. Análisis filogenéticos. Identificación de organismos mediante secuencia de ARN 16S/18S o ITSs. También se abordarán temáticas relacionadas con la manipulación de secuencias de ADN. PCR, RT-PCR. Confirmación de identidad del amplicon; RFLP, nested PCR y secuenciación. Clonado de fragmentos de PCR. Modificación de fragmentos de ADN clonados. Generación de inserciones, deleciones, mutaciones puntuales. Clonado, expresión y purificación por afinidad de proteínas recombinantes en E. coli. Transfección de células de mamíferos. Métodos, plásmidos. ARN interferencia y ensayos para detección y estudio de apoptosis.
Para información: Maximiliano Juri Ayub; mayub@unsl.edu.ar y Jimena Manzur jimemanzur@hotmail.com
